O dolasku franjevaca u Bosnu i osnutku vikarije postoji više teorija.

Ipak, danas se službenim početkom franjevačkog djelovanja smatra godina 1291. kada je papa Nikola IV., na molbu Stjepana Dragutin, poslao dvojicu franjevaca iz Hrvatske s ciljem obraćenja bosanskih krstjana na katoličku vjeru i suzbijanja krivovjerja.
Osnivačem Bosanske vikarije smatra se poglavar Franjevačkog reda fra Gerald Eudes. On se 1339. godine susreo s banom Stjepanom II. Kotromanićem kako bi se dogovorili o suzbijanju krivovjerja u Bosni što bi se najlakše ostvarilo osnivanjem zasebne franjevačke zajednice u Bosni. Tako je, 1340. godine, službeno uspostavljena Bosanska vikarija u Milima.